Caractérisation génomique des espèces de Piscirickettsia salmonis et d’Aeromonas isolées dans les eaux de la Colombie-Britannique afin de guider la gestion de la santé des poissons et d’améliorer les diagnostics

Description

Les maladies bactériennes demeurent un grave problème pour la santé des poissons d’élevage et sauvages en Colombie-Britannique. En particulier, l’infection par les bactéries gram négatif, Aeromonas salmonicida (Asal) et Piscirickettsia salmonis (Psal), sont souvent associées à des pertes de production importantes (croissance réduite et morbidité) dans l’industrie salmonicole de la Colombie-Britannique. De plus, la nécessité d’utiliser des antibiotiques pour traiter ces infections entrave la capacité des entreprises à respecter les normes de certification environnementale, qui comprennent des dispositions relatives à l’utilisation de produits thérapeutiques et à la santé et au bien-être animal.

Pour comprendre la base génomique des différences de sensibilité aux antibiotiques et de virulence, ce projet vise à déterminer les séquences génomiques de P. salmonis, d’A. salmonicida et des trois autres espèces d’Aeromonas que nous avons isolées dans des échantillons cliniques de saumon en Colombie-Britannique. À long terme, ces données permettront de mettre au point de nouveaux tests diagnostiques moléculaires propres à l’espèce ou adaptés à l’identification d’isolats hautement pathogènes ou présentant une sensibilité réduite aux antibiotiques. L’information sur la sensibilité aux antimicrobiens et les facteurs virulents aidera les vétérinaires à prendre des décisions concernant le traitement et la gestion de ces maladies, en plus de favoriser le développement de vaccins.

Nom du programme

Programme coopératif de recherche et développement en aquaculture (PCRDA)

Années

Deux ans : 2019-2021

Chercheur principal

Stewart Johnson, chercheur principal, Pêches et Océans Canada, Station biologique du Pacifique, Région du Pacifique
Courriel : Stewart.Johnson@dfo-mpo.gc.ca

Membres de l’équipe

Ahmed Siah, chercheur, BC Centre for Aquatic Health Sciences
Allison MacKinnon, conseillère technique principale, Elanco Animal Health Canada Ltd.

Collaborateurs

John Paul Fraser, directeur général, BC Salmon Farmers Association