RT-PCR pour identifier les brins réplicatifs de l'ARN du virus de l'AIS

Description

L'anémie infectieuse du saumon (ISA) est causée par un virus et affecte la culture du saumon dans les provinces Atlantiques depuis 1996. Parmi les tests diagnostiques disponibles, le RT-PCR est souvent utilisé et détecte la présence du génome viral dans les tissus. Le virus de l'ISA produit différents brins génomiques pendant la progression d'une infection, dont certains sont nécessaires pour sa réplication, mais qui ne sont pas distingués par les essais courants de RT-PCR. Des craintes justifiées existent en ce qui a trait à la pertinence d'incorporer les résultats de RT-PCR dans le processus d'évaluation des saumons face à l'ISA. Spécifiquement, les tests de RT-PCR existant ne peuvent discriminer entre la présence de particules virales intactes, capables de se répliquer, et des fragments non-viables résultants de la dégradation du virus, non plus qu'ils ne peuvent distinguer les brins réplicatifs d'ARN viral. Une plus grande confiance lors du processus de décision serait obtenue avec un résultat de RT-PCR qui fournirait de l'information concernant la quantité relative d'ARN viral vs la quantité de brins réplicatifs, ces derniers indiquant le potentiel infectieux du virus.

Les objectifs de ce projet sont de développer un test de RT-PCR plus spécifique qui pourrait être utilisé pour déterminer la charge virale d'un échantillon, ou si possible, la capacité du virus d'ISA de se répliquer dans un tissu. Lorsque possible, la corrélation entre la charge virale d'ISA et le statut clinique du poisson (infection déclarée, porteur non infectieux, ou élimination de l'infection) serait établie.

Nom du programme

Programme coopératif de recherche et développement en aquaculture (PCRDA)

Année

2001 - 2004

Écorégion

Atlantique : Golfe du Maine, plateau néo-écossais

Chercheur principal / Chercheurs principaux / Chercheuse principale / Chercheuses principales

Nellie Gagné
Courriel: Nellie-Gagne.Davidson@dfo-mpo.gc.ca