Isolation, culture et analyse génomique des espèces d'algues nuisibles pour l'aquaculture de la côte Ouest du Canada, et analyse de la base de données historiques du Programme de surveillance des algues nuisibles
P-12-01-003
Description
La prolifération d'algues nuisibles entraîne des pertes économiques considérables, en causant la mort des poissons et des mollusques d'élevage. Elle peut également nuire à la santé humaine. Le Programme de surveillance des algues nuisibles a été établi en 1999 en tant que programme communautaire avec l'appui de l'industrie aquacole du saumon de la Colombie-Britannique (C.-B.), dans le but de s'attaquer aux effets dévastateurs des algues nuisibles sur les poissons d'élevage. Grâce à une surveillance microscopique systématique d'échantillons d'eau, le Programme de surveillance des algues nuisibles a fourni aux compagnies d'aquaculture du saumon des données de surveillance et des alertes rapides de prolifération dans les sites d'élevage. Cependant, il faut davantage de recherche pour améliorer les connaissances en matière de prolifération d'algues nuisibles ainsi que la capacité à prédire la prolifération en analysant des données historiques. Les chercheurs doivent identifier certaines espèces d'algues nuisibles qui prolifèrent, les cultiver aux fins d'étude, et analyser des données antérieures du Programme de surveillance des algues nuisibles pour déterminer des tendances éventuelles. L'objectif principal du projet est d'isoler et de cultiver des espèces de microalgues reconnues pour être nuisibles aux poissons d'élevage et aux mollusques en Colombie-Britannique. Ces cultures seront utilisées pour l'identification détaillée des espèces, des études préliminaires des variations physiques de chaque espèce sélectionnée, l'élaboration d'analyses de réaction en chaîne de la polymérase (PCR) propres aux espèces, et la création d'une banque d'images et d'une base de données sur les algues nuisibles locales. Ces outils seront utilisés pour améliorer les stratégies actuelles de formation et de surveillance afin d'appuyer les compagnies d'aquaculture et le Programme de surveillance des algues nuisibles. Le deuxième but de ce projet est d'effectuer des analyses génomiques de tissu branchial de mollusques pour déterminer les réactions génomiques et biologiques à la prolifération d'algues nuisibles et de lier ces réactions à des espèces particulières d'algues. Finalement, on doit procéder à une analyse rétrospective des 13 dernières années de données du Programme de surveillance des algues nuisibles. On doit ainsi améliorer sensiblement les connaissances en matière de tendances spatiales et temporelles de le prolifération d'algues nuisibles locales et contribuer à l'amélioration des stratégies actuelles de surveillance et d'atténuation de e type de prolifération.
Nom du programme
Programme coopératif de recherche et développement en aquaculture (PCRDA)
Année
2012 - 2014
Écorégion
Pacifique : Côte Ouest de l'île de Vancouver
Chercheur principal / Chercheurs principaux / Chercheuse principale / Chercheuses principales
Chris Pearce
Courriel: Chris.Pearce@dfo-mpo.gc.ca
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