Élaboration et validation d'un outil de biosurveillance servant à évaluer les effets de la salmoniculture sur les communautés marines benthiques au moyen du métacodage à barres

PRRA-2016-P-06

Description

La salmoniculture entraîne l'enrichissement organique des sédiments environnants, ce qui a des conséquences sur la biodiversité et la biomasse de la faune benthique associée à des changements dans la chimie des sédiments. Les études d’impact sur l’environnement ont généralement porté sur les changements dans les communautés de macro-invertébrés en fonction de leur identification taxonomique manuelle, nécessitant un investissement important en travail et en expertise taxonomique, ou ont eu recours à des approximations abiotiques comme les mesures des sulfures, dont l'exactitude et la fiabilité sont incertaines. Les méthodes de séquençage de l'ADN de prochaine génération offrent une solution de rechange efficace, fiable et à moindre coût en procédant au catalogage de la diversité et de l'abondance des communautés benthiques au moyen du métacodage à barres de l'ADN environnemental (ADNe). Cette approche a permis de déterminer les impacts environnementaux associés aux activités d'élevage en Écosse, en Nouvelle-Zélande et en Norvège. Ce projet permettra d'élaborer un nouvel outil de métacodage à barres fondé sur l'ADNe pour évaluer les répercussions des activités d'élevage sur des communautés benthiques de métazoaires et de foraminifères en Colombie-Britannique et validera son utilisation aux fins de biosurveillance continue grâce à des comparaisons avec les méthodes existantes. Cette recherche permettra également de combler les lacunes existantes dans les connaissances concernant les répercussions de la salmoniculture sur les communautés benthiques de métazoaires et de foraminifères et d'enrichir les bases de données des codes à barres d'ADN pour ces taxons dans les eaux côtières de la Colombie-Britannique.

Constatations

S.O.

Publications

S.O.

Nom du programme

Programme de recherche sur la réglementation de l'aquaculture (PRRA)

Année

2016 - 2019

Chercheur principal

Cathryn Abbott
Chercheuse, Station biologique du Pacifique
Courriel: Cathryn.Abbott@dfo-mpo.gc.ca