Création d'un ensemble de données génétiques de référence pour l'identification des différentes populations de saumon de l’Atlantique Nord-Ouest et l'analyse de la composition des pêches canadiennes et internationales

Description

L'analyse génétique des populations de saumon de l’Atlantique a donné lieu à des percées dans l'identification des stocks; cependant, les groupes régionaux sont souvent plus imposants et sont constitués de populations présentant un risque plus ou moins grave d'extinction. Cela ne correspond pas nécessairement aux besoins en matière de gestion des pêches et, par conséquent, des pressions croissantes s'exercent sur le plan national et international en faveur de l'examen de nouvelles options qui mèneraient à l'obtention de données plus précises sur les populations de saumon en affinant l'échelle géographique où sont prélevées ces données. Ce projet vise à fournir un meilleur ensemble de données génétiques de référence sur le saumon de l’Atlantique en étendant la couverture à des zones qui ne sont actuellement pas adéquatement représentées dans les données de références. Cette solution rapide et peu coûteuse répond aux besoins du client en rendant possible l'identification des stocks et des espèces au moyen d'un test unique et accessible.

Les ressources génomiques nouvelles et anciennes seront combinées afin de créer un ensemble de marqueurs génétiques de référence grâce auquel il sera possible d'effectuer une analyse génétique rapide à peu de frais. En ciblant l'ADN qui évolue rapidement en raison de l'adaptation aux conditions locales, il sera plus aisé de définir la structure à petite échelle des populations importantes sur le plan évolutionnaire. Le nouvel ensemble de marqueurs génétiques ainsi obtenu :

1. intégrera aux ensembles de données existants les nouvelles données obtenues dans les régions où peu d'échantillons ont été prélevés jusqu'à présent (c.-à-d. Terre-Neuve-et-Labrador et les Maritimes) afin de créer un ensemble de données de référence nord-américain plus detaillé;
2. comprendra des marqueurs génétiques qui permettent de déterminer le sexe et l'espèce afin de répondre aux besoins du client en matière d'évaluation des stocks et d'application de la réglementation;
3. s'appliquera à l'analyse des pêches de stocks mélangés au Canada (c.-à-d. à Terre-Neuve-et-Labrador) et à l'étranger (c.-à-d. au Groenland et à St-Pierre et Miquelon) à des fins de gestion des pêches.

Titre du projet scientifique :

Scénario de référence du SNP à l'échelle de l'aire de répartition pour une analyse génétique améliorée du stock mélangé du saumon de l’Atlantique vivant dans l'Atlantique Nord-Ouest

Nom du programme

Initiative de recherche et développement en génomique (IRDG)

Année

2014 - 2017

Chercheur principal / Chercheurs principaux / Chercheuse principale / Chercheuses principales

Dr. Ian Bradbury
responsable de projet

Lorraine Hamilton

Elizabeth Nagel

Vicki Morris