Initiative de recherche et développement en génomique

La gestion des ressources halieutiques, y compris les mammifères marins, a pour objectif le maintien des populations et des stocks qui assurent la durabilité à long terme de ces ressources. Les demandes d'avis scientifiques portant sur des mammifères marins présentées au cours des quelques dernières années touchent principalement des questions de gestion du narval. Ces questions soulignent la nécessité d'établir les limites des stocks à des f...

Principaux chercheurs : Lianne Postma, Denise Tenkula, Steven Ferguson, Cortney Watt

Les données nécessaires à l'estimation du taux de mortalité au sein de chacune des populations de saumon du Pacifique proviennent actuellement du programme de micromarque magnétisée codée. Toutefois, des préoccupations ont été exprimées relativement au fait que, sous sa forme actuelle, le programme géré par Pêches et Océans Canada (MPO) pour l'évaluation des populations de saumon quinnat n'est plus viable financièrement et que certaines décis...

Principaux chercheurs : Dr. Terry Beacham, Dave Willis, Cheryl Lynch

Il importe d'identifier les stocks de sébaste qui disposent d'un éventail de stratégies d'adaptation à l'environnement afin de prévoir l'état des stocks, d'établir des priorités de conservation et de mettre en œuvre de meilleures pratiques de gestion à long terme. Au cours des 15 dernières années, les marqueurs génétiques neutres, soit la portion de l'ADN qui ne donne pas d'indication sur la capacité d'adaptation d'une espèce, ont été utiles ...

Principaux chercheurs : Yvan Lambert, Rick Rideout, Don Power, Éric Parent, Jean-Marie Sévigny

La pisciculture du saumon de l’Atlantique a explosé vers la fin des années 1960; elle a depuis gagné de nouvelles zones géographiques (p. ex., Terre-Neuve-et-Labrador) et a donné lieu à l'utilisation de souches obtenues par élevage sélectif en Amérique du Nord comme en Europe. Cette expansion a entraîné un risque accru d'évasion des saumons d'élevage, ce qui pourrait avoir une incidence sur la diversité des populations de saumon sauvage de l'...

Principaux chercheurs : Dr. Ian Bradbury, Lorraine Hamilton, Geoff Perry

Les activités de restauration, de mise en valeur et de conservation des stocks de saumon du Pacifique à l'appui des pêches mais aussi du maintien de la biodiversité des espèces de salmonidés de la côte Ouest du Canada prennent de plus en plus d'ampleur. Les lâchers de poissons d'élevage et l'élevage en captivité du saumon rouge et du saumon quinnat ont permis de stabiliser l'abondance, de maintenir la diversité génétique au sein des populati...

Principaux chercheurs : Ruth Withler, Dave Willis, Mel Sheng, Wilf Luedke

Le crabe vert (Carcinus maenas) est un prédateur aquatique envahissant dont la présence a des répercussions sur la pêche commerciale (p. ex., la pêche à la mye) et les écosystèmes (p. ex., les herbiers de zostère). Bien que la pêche au pétoncle géant (Placopecten magellanicus) soit l'une des plus rentables de l'Atlantique canadien, on comprend encore mal les échanges génétiques qui peuvent se produire entre les différents stocks. D'un point d...

Principaux chercheurs : Dr. Claudio DiBacco, Dr. Ian Bradbury, Lorraine Hamilton, Dr. Cynthia McKenzie, Dr. Stephen Smith, Leslie-Anne Davidson

Le capelan (Mallotus villosus) est un poisson fourrage important faisant l'objet d'une pêche commerciale et dont les principales populations se trouvent dans le Nord du Pacifique et de l'Atlantique. Selon l'analyse de la forme, les étiquettes récupérées et les profils de répartition saisonniers, il a été déterminé que quatre stocks de capelans vivent dans l'Atlantique Nord-Ouest. Cependant, une étude antérieure indique que les regroupements d...

Principaux chercheurs : Ellen Kenchington, Lorraine Hamilton, Brian Nakashima, Fran Mowbray

L'utilité de l'ADN environnemental (ADNe), soit l'ADN isolé d'échantillons environnementaux (p. ex., eau, terre), est de plus en plus reconnue par les chercheurs qui visent à détecter la présence d'organismes qui ne devraient pas se trouver dans un écosystème donné. Cette technique représente une solution de rechange efficace et peu coûteuse aux méthodes de surveillance (p. ex., la pêche aux filets ou à l'électricité) habituellement utilisées...

Principaux chercheurs : Robert Bajno, Karen Dunmall, Tim Gingera, Jim Reist

L'analyse génétique des populations de saumon de l’Atlantique a donné lieu à des percées dans l'identification des stocks; cependant, les groupes régionaux sont souvent plus imposants et sont constitués de populations présentant un risque plus ou moins grave d'extinction. Cela ne correspond pas nécessairement aux besoins en matière de gestion des pêches et, par conséquent, des pressions croissantes s'exercent sur le plan national et internati...

Principaux chercheurs : Dr. Ian Bradbury, Lorraine Hamilton, Elizabeth Nagel, Vicki Morris

Le changement climatique, les défis liés à l'hérédité, l'instabilité écologique et la maladie sont tout autant d'agents de stress qui perturbent les populations de saumons sauvages de la côte Ouest du Canada. Ce projet se penchera sur l'état physique des populations sauvages en concevant une série de « FIT-CHIP » qui serviront à prédire la condition du saumon. Ce système est caractérisé par une grande souplesse d'utilisation; il est facile de...

Principaux chercheurs : Dr. Kristi Miller-Saunders, Paul Pavlidis

Depuis la première identification du virus de l'anémie infectieuse du saumon (AIS), diverses souches présentant des niveaux de virulence (toxicité) variables ont été découvertes. On trouve à la fois des souches essentiellement avirulentes, par exemple de type HPR0, et des souches hautement virulentes comme la HPR4, ainsi que de nombreux types de souches de virulence intermédiaire. Ce projet de recherche repose sur l'idée que la souche HPR0 d...

Principaux chercheurs : Nellie Gagné, Francis Leblanc, Mark Laflamme, Brian Glebe, Steve Leadbeater

Le changement climatique et la variabilité accrue dans l'ouest de l'Arctique ont une incidence considérable sur les poissons d'eau douce, anadromes et marins, ainsi que sur leurs habitats et écosystèmes respectifs. Cette question urgente a orienté le projet, qui s'est penché sur les différentes priorités suivantes : la recherche visant à soutenir la gestion durable des pêches en Arctique (p. ex., Plan de gestion intégrée des pêches du Dolly ...

Chercheur principal : Jim Reist

La majorité des populations de saumon de l'Atlantique Nord-Ouest sont menacées ou en voie d'extinction et il est essentiel d'estimer l'impact des changements climatiques et des pêches de subsistance pour pouvoir élaborer des stratégies de reconstruction et des programmes de rétablissement. Grâce à l'identification des gènes associés aux changements climatiques et à l'adaptation génétique chez le saumon de l'Atlantique, ces travaux ont permis ...

Principaux chercheurs : Dr. Ian Bradbury, Dr. Patrick O’Reilly

La maladie a été choisie dans une liste de facteurs qui seraient responsables du déclin du saumon rouge du fleuve Fraser. Il existe divers agents pathogènes entraînant des maladies et des décès chez le saumon rouge et parmi ceux-ci, la contagion par le virus de la nécrose hématopoïétique infectieuse (VNHI) est reconnue comme létale. D'importants problèmes restent à résoudre concernant le VNHI, notamment ses origines, sa transmission et son im...

Principaux chercheurs : Kyle Garver, Stewart Johnson, Ben Koop, Scott LaPatra

La conservation du sébaste atlantique dans l'ensemble des zones de pêche de l'Atlantique est importante pour le Canada. Les nouveaux renseignements recueillis dans le cadre de cette étude aideront à élaborer et à mettre en œuvre des mesures de gestion et de conservation pour cette espèce. Le sébaste atlantique (Sebastes mentella) est distribué à l’échelle de l'Atlantique Nord. Par conséquent, la gestion durable de cette ressource exige une bo...

Principaux chercheurs : Jean-Marie Sévigny, Don Power, Christoph Stransky

Cette recherche devrait s'avérer bénéfique aux travaux du Ministère pour cinq raisons elle aide à gérer les populations et les écosystèmes en voie de disparition et menacés; elle aide à déterminer les conséquences des interactions entre les saumons sauvages et d'élevage; elle aide à évaluer la propagation des espèces aquatiques envahissantes dans les habitats côtiers; elle fournit des données sur les réponses adaptatives possibles des espèce...

Principaux chercheurs : Dr. Ian Bradbury, Dr. Claudio DiBacco, Lorraine Hamilton

L'un des principaux objectifs de cette recherche de déterminer les états conditionnels du saumon sauvage migrateur pouvant être associés à un faible rendement lorsque les saumoneaux passent dans l'océan et que les adultes migrent vers les cours d'eau douce pour frayer. Suivant ce thème, une recherche interne à grande échelle en génomique a permis de découvrir une signature génomique répandue et puissante (SAM) chez le saumon rouge adulte dans...

Chercheur principal : Dr. Kristi Miller

Ce projet vise à accroître et à perfectionner la capacité de détermination de la structure des populations de morues, notamment celle de la baie de Gilbert, à l'aide de techniques génétiques, les renseignements ainsi obtenus servant ensuite à améliorer les avis en matière de gestion de pêches. La population de morues de la baie de Gilbert, protégée, n'existe plus qu'en faible nombre. Ce projet de recherche permettrait d'établir génétiquement ...

Principaux chercheurs : Corey Morris, Ian Bradbury, Lorraine Hamilton, Laura Park, John Brattey, Robert Gregory, Carl Bradley, John Green, Roland Kemuksigak

L’analyse de l’ADN environnemental est devenue un moyen efficace de détecter la présence de différentes espèces dans les milieux aquatiques, et un outil important pour gérer les espèces envahissantes et les espèces en péril. Les améliorations permanentes des techniques d’analyse de l’ADN ont débouché sur des dispositifs portatifs de PCR quantitative (qPCR) permettant de détecter, d’identifier et de quantifier l’ADN environnemental sur le terrain.

Principaux chercheurs : Robert Bajno, Jim Reist

La gestion actuelle du saumon quinnat d’élevage en Colombie-Britannique dépend fortement de méthodes de micromarquage magnétisé codé (MMC) pour faire le suivi des individus relâchés dans la nature. À grande échelle, ces micromarques peuvent s’avérer onéreuses et elles ne peuvent être posées que sur une partie des poissons juvéniles lors du lâcher.

Chercheur principal : Terry Beacham

Malgré leur importance culturelle, économique et écologique, la structure et la diversité des populations de poissons arctiques demeurent en grande partie inconnues. L’accroissement de l’exploitation des espèces de poissons de l’Arctique, sans une compréhension claire de la structure des populations, risque d’entraîner la perte de la diversité adaptative et de menacer la stabilité et la persistance des espèces.

Chercheur principal : Ian Bradbury

L’analyse de l’ADN environnemental est devenue un moyen efficace de détecter la présence de différentes espèces dans les milieux aquatiques, et un outil important pour gérer les espèces envahissantes et les espèces en péril. Des techniques de quantification de l’ADN, comme la PCR quantitative (qPCR) et les plateformes microfluidiques permettent de détecter, d’identifier et de quantifier l’ADN environnemental excrété par les organismes aquatiques dans l’environnement.

Chercheurs principaux : Nellie Gagné, Francis LeBlanc

Il est essentiel de comprendre la structure des stocks pour bien gérer les pêches. Malgré la grande valeur commerciale et culturelle des pêches de morue franche (Gadus morhua), peu d’améliorations ont été apportées à la mise à jour de la délimitation du stock. Pourtant, de récentes percées en génomique permettent d’effectuer des analyses spatiales à fine résolution des stocks, populations et sous-populations de morues.

Chercheurs principaux : Geneviève Parent, Yanjun Wang