ADN environnemental (ADNe)
Découvrez l’ADNe, un outil transformateur qui, aux côtés d’autres méthodes, peut changer la façon dont nous surveillons les environnements aquatiques.
Qu’est-ce que l’ADNe?
L’ADN environnemental (ADNe) est le matériel génétique déposé par les organismes dans leur environnement. L’analyse de l’ADNe, prélevée à partir d’échantillons d’eau ou de sédiments, permet aux chercheurs d’identifier les organismes présents à un endroit. L’analyse de l’ADNe représente un moyen efficace, non invasif et rentable de détecter et de suivre différentes espèces, de soutenir les programmes de suivi et de surveillance des espèces et d’effectuer des évaluations globales de la biodiversité.
Comment cela fonctionne-t-il?
En termes généraux, l’analyse de l’ADNe peut être expliqué en cinq étapes :
- Les scientifiques prélèvent à partir de sédiments ou d’eau des échantillons qui contiennent du matériel génétique (ADN) laissé par les organismes.
- Les échantillons prélevés sont envoyés à un laboratoire et passent à travers un filtre pour extraire le matériel génétique (ADN) des sédiments ou de l’eau pour une analyse plus approfondie.
- Les scientifiques créent plusieurs copies de l’ADN extrait en utilisant un processus appelé amplification. Cette étape permet de réaliser de nombreuses copies de l’ADN (appelées ADN amplifié) afin que l’ADN présent dans les échantillons puisse être détecté et attribué à une espèce spécifique en toute confiance.
- Les scientifiques comparent l’ADN amplifié aux séquences d’ADN connues des espèces stockées dans des bases de données en ligne. Cette étape permet d’identifier les organismes présents dans l’environnement aquatique et de comprendre la biodiversité de la zone.
- Les scientifiques communiquent leurs découvertes ou leurs résultats sous la forme de rapports, de publications ou de présentations afin de faire progresser notre compréhension de la diversité, de la présence, de la répartition et de l’utilisation de l’habitat des espèces.
Utilisations de l’ADNe
En combinaison avec d’autres méthodes, l’analyse de l’ADNe est un outil efficace, non invasif et rentable pour soutenir les mesures de gestion durable des espèces. Voici quelques-unes des façons dont nous utilisons l’ADNe :
- Surveillance de la biodiversité : l’ADNe peut nous aider à surveiller les espèces au sein d’un environnement. Nous pouvons compter le nombre d’espèces présentes dans une zone pour en mesurer la biodiversité, c’est-à-dire les différents types d’organismes vivants qui existent dans un endroit donné. Cette approche peut nous aider à comprendre la répartition, la diversité et l’abondance relative des espèces dans une zone donnée, ainsi que leur utilisation de l’habitat, ce qui en fait un outil puissant pour la gestion de la pêche, la surveillance de l’environnement aquatique et les efforts de conservation.
- Détection des espèces envahissantes : lel’analyse de l’ADNe est un outil efficace pour la détection précoce des espèces aquatiques envahissantes. Elles permettent de détecter les espèces envahissantes avant qu’elles ne soient visibles, par exemple à leurs premiers stades de vie (tels que les larves), lorsqu’elles sont difficiles à identifier visuellement et que leur abondance est encore faible. L’utilisation de l’ADNe pour détecter les espèces envahissantes permet d’éclairer les mesures de gestion visant à contrôler les espèces envahissantes. Les méthodes d’ADNe ont déjà été utilisées avec succès dans des études sur les espèces envahissantes, telles que la carpe asiatique, le crabe vert européen, ainsi que les moules zébrées et quagga.
- Cartographie des espèces : l’analyse de l’ADNe nous aide à découvrir, à identifier et à suivre la répartition de différentes espèces, y compris les espèces peu communes et/ou vivant dans des habitats particuliers (espèces rares), les espèces vulnérables aux menaces pesant sur leur survie (en péril) et les espèces difficiles à identifier (cryptiques). La cartographie des espèces à l’aide de l’ADNe nous aide à identifier et à évaluer l’habitat des animaux, la répartition, et l’habitat associées à différentes espèces.
Nos travaux sur l’ADNe
Chaque jour, nos scientifiques utilisent les méthodes d’ADNe pour mieux comprendre nos écosystèmes aquatiques. Nous collaborons activement avec différents intervenants et participons aux efforts déployés par l’Association canadienne de normalisation et l’International eDNA Standardization Task Force (iESTF), afin d’élaborer des protocoles normalisés pour la collecte, le stockage et l’analyse de l’ADNe. La normalisation de cette méthode permet d’améliorer la fiabilité et la comparabilité des résultats basées sur l’ADNe, ainsi que de faciliter la collaboration et l’échange des données.
Nous sommes également fiers que notre Centre des pêches du Golfe soit un laboratoire agréé par l’Organisation internationale de normalisation (ISO) 17025 pour l’analyse de l’ADNe des espèces aquatiques envahissantes. L’agrément certifie que les résultats produits par le laboratoire répondent aux normes internationales en matière de précision et de fiabilité.
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